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摺耳貓的骨骼遺傳病
摺耳貓的遺傳性骨骼病稱為「軟骨骨質化發育異常」。發病年齡一般從兩個月到六個月大不等。然而，最近亦有病例顯示已成年（一歲以後）的摺耳貓亦有機會病發。
病發初期，貓咪會表現得不愛活動，其後行動會出現障礙，明顯病徵包括：後肢出現跛行現象、經常把手提起、弓背、走路時像是踩高蹺般等等。此外，貓咪的尾巴顯得粗短，關節僵硬不能擺動。後肢的骨骼及關節發育異常，腳骨畸形彎曲，較正常貓咪的短。腳掌骨骼及關節腫大，有些貓咪的腳趾甚至變得畸形，爪子不能正常伸縮。前肢也會出現類似徵狀但程度較後肢為輕。不正常生長的骨骼及軟骨組織令到貓咪感到痛楚，因而減低活動能力。
1975年，英國Dr. O Jackson的研究指出出現這種遺傳病的原因是由於讓兩頭皆為摺耳的貓交配而造成。他認為只要讓摺耳貓跟沒有摺耳的貓交配便可避免生出有遺傳病的小貓。然而，根據澳洲悉尼大學的Dr. Richard Malik於1999年的研究指出，所有擁有摺耳基因的摺耳貓都有機會出現某程度的骨骼及關節病變。能避免這種遺傳病的唯一方法就是放棄繁殖摺耳貓。此外，從現今的病例所證明，摺耳貓跟非摺耳貓所生出的小貓同樣會得到這種遺傳病。
對於這種遺傳病，一般要等貓咪出現病徵時才會發現，亦沒有辦法可以根治，而且病情大多會不斷惡化。目前獸醫只能用葯物舒緩病情，幫助貓咪減輕痛楚及減慢惡化速度。貓咪一生也要在痛楚及食葯中渡過。一些病情嚴重的貓咪，骨骼病變的情況會慢慢蔓延至脊骨，令貓咪癱瘓並引致極大的痛楚。當貓咪無法承受那種痛楚時，主人就要忍痛讓貓咪安樂死。

摺耳貓的其他疾病
除了骨骼遺傳病外, 以下疾病亦常見於摺耳貓身上:-
1. 呼吸管道毛病 – 骨骼病變的基因除了影響手腳骨骼外, 亦會影響身體其他部份的軟骨組織發育異常。較為常見的是摺耳貓的呼吸管道收窄引起呼吸不暢順, 嚴重者需要施以外科手術來擴闊呼吸管道。此外, 亦有摺耳貓有噴鼻血的問題 (就是打噴嚏的時候會連同鼻血一併噴出), 估計可能是發炎所致, 亦暫時未有方法治癒。
2. 體質較弱 – 基因不良的摺耳貓體格亦較一般貓差, 我們有病友的摺耳貓咪體形及體重只有正常貓的一半。
3.心臟病 –心肌肥大症也是常見於摺耳貓身上。得到此病的貓咪除要控制飲食外, 更要終生服葯。而此病是很難發現, 一般要到嚴重的時候才會見到病徵, 因此非常危險。
4.先天免疫力弱 - 因免疫系統弱而常有流鼻水, 打噴嚏, 傷風, 輕微貓瘟, 皮膚病, 腸胃, 過敏等問題, 亦可能因為一些小毛病而誘發出足以玫命的併發症. 獸醫提這都是因為摺耳貓先天免疫力薄弱所致, 特別容易染病.